| Meno: | Eduard
|
|---|
| Priezvisko: | Batmendijn
|
|---|
| Názov: | Identifikácia variantov v dátach nanopórového sekvenovania
|
|---|
| Vedúci: | doc. Mgr. Tomáš Vinař, PhD.
|
|---|
| Rok: | 2018
|
|---|
| Kľúčové slová: | sekvenovanie DNA, varianty, MinION
|
|---|
| Abstrakt: | V niektorých aplikáciách sekvenovania DNA je potrebné zistiť, ako sa sekvenovaná
DNA líši od referenčnej DNA postupnosti. V našej práci navrhujeme pravdepodob-
nostný model, pomocou ktorého na základe referenčnej DNA a signálu zo sekvenátora
MinION identifikujeme bázy, ktoré sa v sekvenovanej DNA líšia od referencie. Pri testo-
vaní v ideálnych podmienkach dáva tento model presnejšie výsledky, než postup, ktorý
najprv zo signálu štandardným spôsobom určí postupnosť báz a potom túto postupnosť
porovná s referenciou.
|
|---|