| Meno: | Roman |
|---|---|
| Priezvisko: | Beňo |
| Názov: | Alignment of Nanopore Reads to Graphs |
| Vedúci: | doc. Mgr. Tomáš Vinař, PhD. |
| Rok: | 2020 |
| Kľúčové slová: | nanopórové sekvenovanie, sekvenčný graf, dynamic time warping |
| Abstrakt: | Výstupom nanopórového sekvenátora, zariadenia na rozpoznávanie postupnosti dusíkatých báz v molekule DNA, je séria číselných hodnôt, ktorá je následne za účelom využiteľnosti v množstve dostupných analytických nástrojov konvertovaná do inej podoby. Táto konverzia však zároveň zvyšuje mieru jej chybovosti. Cieľom je práce je vyvinúť software, ktorý by umožnil vykonať na sekvencii istý typ analýzy bez nutnosti predošlej konverzie. Konkrétne pôjde o porovnanie sekvencie s množstvom už osekvenovaných, spoľahlivých sekvencii uložených v špecializovanej dátovej štruktúre zvanej sekvenčný graf. Takýto software by vedel byť v budúcnosti využitý napríklad pre stanovenie živočíšneho druhu neznámej vzorky. |
Súbory bakalárskej práce:
Autor nedal súhlas so zverejnením svojej bakalárskej práce.
Súbory prezentácie na obhajobe:
| Obhajoby.pdf |