| Abstrakt: | Táto bakalárska práca sa zaoberá analýzou genetických variantov vírusu SARS-CoV-2 prostredníctvom bioinformatických nástrojov, ktoré umožňujú spracovanie a interpretáciu veľkých objemov sekvenčných dát. Na Fakulte matematiky, fyziky a informatiky bol vyvinutý softvér VirPool, ktorý umožňuje určiť zastúpenie jednotlivých variantov vírusu v zmesovej vzorke, napríklad aj z odpadových vôd. Zamerali sme sa na návrh a implementáciu nástroja pre výpočet genómových profilov variantov SARS-CoV-2. Naším cieľom bolo vytvoriť dátovú reprezentáciu variantov, ktorá je vhodná na použitie v softvéri VirPool. Implementovaný nástroj pracuje s verejne dostupnými dátami a produkuje výstup vo formáte kompatibilnom s požiadavkami. Výpočtový model zohľadňuje hierarchiu variantov, ich mutačné charakteristiky a relatívnu početnosť. Výsledky boli overené experimentálne na syntetických dátach, kde nový nástroj potvrdil svoju funkčnosť a praktickú využiteľnosť pri príprave vstupov pre systém VirPool.
|
|---|