| Meno: | Kristián
|
|---|
| Priezvisko: | Andraščík
|
|---|
| Názov: | Využitie homológie v rozpoznávaní bakteriálnych plazmidov
|
|---|
| Vedúci: | doc. Mgr. Bronislava Brejová, PhD.
|
|---|
| Rok: | 2025
|
|---|
| Kľúčové slová: | plazmid, plASgraph2, homológia
|
|---|
| Abstrakt: | V tejto práci sme sa zamerali na vylepšenie systému plASgraph2, ktorý slúži na rozpoznávanie
plazmidov. Plazmidy sú molekuly DNA nachádzajúce sa v bakteriálnych
bunkách a môžu prenášať gény rezistencie voči antibiotikám. Vstupné parametre plASgraph2
sme rozšírili o informácie o podobnosti génových sekvencií. Na základe známych
sekvencií sme vytvorili model čiastkových sekvencií spolu s ich relatívnym výskytom
v plazmidových a neplazmidových sekvenciách. Dotazovanú sekvenciu sme najprv porovnali
so sekvenciami nášho modelu a pokúsili sa určiť jej príslušnosť. Tento údaj o
príslušnosti sme následne pridali do plASgraph2.
|
|---|