Meno:Kristián
Priezvisko:Andraščík
Názov:Využitie homológie v rozpoznávaní bakteriálnych plazmidov
Vedúci:doc. Mgr. Bronislava Brejová, PhD.
Rok:2025
Kľúčové slová:plazmid, plASgraph2, homológia
Abstrakt:V tejto práci sme sa zamerali na vylepšenie systému plASgraph2, ktorý slúži na rozpoznávanie plazmidov. Plazmidy sú molekuly DNA nachádzajúce sa v bakteriálnych bunkách a môžu prenášať gény rezistencie voči antibiotikám. Vstupné parametre plASgraph2 sme rozšírili o informácie o podobnosti génových sekvencií. Na základe známych sekvencií sme vytvorili model čiastkových sekvencií spolu s ich relatívnym výskytom v plazmidových a neplazmidových sekvenciách. Dotazovanú sekvenciu sme najprv porovnali so sekvenciami nášho modelu a pokúsili sa určiť jej príslušnosť. Tento údaj o príslušnosti sme následne pridali do plASgraph2.

Súbory bakalárskej práce:

Kristián_Andraščík-bakalárska_práca.pdf

Súbory prezentácie na obhajobe:

Upraviť