Meno: | Kristián |
---|---|
Priezvisko: | Andraščík |
Názov: | Využitie homológie v rozpoznávaní bakteriálnych plazmidov |
Vedúci: | doc. Mgr. Bronislava Brejová, PhD. |
Rok: | 2025 |
Kľúčové slová: | plazmid, plASgraph2, homológia |
Abstrakt: | V tejto práci sme sa zamerali na vylepšenie systému plASgraph2, ktorý slúži na rozpoznávanie plazmidov. Plazmidy sú molekuly DNA nachádzajúce sa v bakteriálnych bunkách a môžu prenášať gény rezistencie voči antibiotikám. Vstupné parametre plASgraph2 sme rozšírili o informácie o podobnosti génových sekvencií. Na základe známych sekvencií sme vytvorili model čiastkových sekvencií spolu s ich relatívnym výskytom v plazmidových a neplazmidových sekvenciách. Dotazovanú sekvenciu sme najprv porovnali so sekvenciami nášho modelu a pokúsili sa určiť jej príslušnosť. Tento údaj o príslušnosti sme následne pridali do plASgraph2. |
Súbory bakalárskej práce:
Kristián_Andraščík-bakalárska_práca.pdf |
Súbory prezentácie na obhajobe: