Vedúci práce | Pracovisko | Názov práce | Popis práce | Požiadavky na diplomanta |
---|---|---|---|---|
Andrej Bebják | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Pavol Ďuriš | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Michal Forišek | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Rastislav Královič | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Dana Pardubská | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Mária Pastorová | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Juraj Procházka | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Branislav Rovan | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Martin Škoviera | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Eduard Toman | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Tomáš Plachetka | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Jaroslav Janáček | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Daniel Olejár | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Richard Ostertág | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Martin Stanek | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Peter Gaži | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Miroslava Kemeňová | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Tomáš Kulich | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Robert Lukoťka | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Martin Macko | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Ján Mazák | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Stanislav Miklík | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Michal Rjaško | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Edita Rollová | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Ľuboš Steskal | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Tomáš Záthurecký | KI FMFI UK | Po dohode s vedúcim práce | Podľa témy práce | Podľa témy práce |
Tomáš Vinař | KAI FMFI UK | Hľadanie génov so zásahmi užívateľa | Jedným zo základných problémov výpočtového spracovania DNA sekvencií je hľadanie génov, t.j. úsekov kódujúcich proteíny. Na tento účel sa často používajú pravdepodobnostné modely, napríklad skryté Markovove modely. V tejto téme bude úlohou navrhnúť a implementovať algoritmy na vizualizáciu a grafické prostredie, v ktorom by užívateľ mohol interagovať s modelom a kombinovať jeho predikcie so svojou intuíciou. | anglický jazyk, záujem rozšíriť si obzory do iných oblastí (napr. biológie), kladný vzťah k algoritmom a k pravdepodobnosti, ochota aktívne sa zúčastňovať na práci bioinformatickej vedeckej skupiny (hlavne účasť na seminároch a lab meetingoch), znalosť Linuxu, skúsenosť s programovaním grafických prostredí (napr. v Jave) |
Tomáš Vinař | KAI FMFI UK | Algoritmické problémy v aplikáciách nových technológií sekvenovania DNA | Najnovšie technológie na sekvenovanie DNA produkujú veľké množstvá dát často útržkovitej povahy. Cieľom bude preštudovať vznikajúce prístupy na spracovanie týchto dát a navrhnúť ich vylepšenia. | anglický jazyk, záujem rozšíriť si obzory do iných oblastí (napr. biológie), kladný vzťah k algoritmom a k pravdepodobnosti, ochota aktívne sa zúčastňovať na práci bioinformatickej vedeckej skupiny (hlavne účasť na seminároch a lab meetingoch) |
Tomáš Vinař | KAI FMFI UK | Pravdepodobnostné modely pre alternatívny zostrih | Jedným zo základných problémov výpočtového spracovania DNA sekvencií je hľadanie génov, t.j. úsekov kódujúcich proteíny. Existujúce metódy väčšinou predpokladajú, že jednotlivé gény sa neprekrývajú. Je však známe, že veľa génov existuje v niekoľkých navzájom sa prekrývajúcich variantách. Úlohou bude navrhnúť pravdepodobnostný model a príslušné algoritmy na systematické | anglický jazyk, záujem rozšíriť si obzory do iných oblastí (napr. biológie), kladný vzťah k algoritmom a k pravdepodobnosti, ochota aktívne sa zúčastňovať na práci bioinformatickej vedeckej skupiny (hlavne účasť na seminároch a lab meetingoch) |
Bronislava Brejová | KI FMFI UK | Integrácia zložitej externej informácie do skrytých Markovových modelov | Skryté Markovove modely (HMM) sú vhodným nástrojom na spracovanie sekvencií DNA a proteínov. Avšak problematické je ich spájanie s ďalšími zdrojmi externých dát. Existujúce prístupy väčšinou uvažujú dáta týkajúce sa jedného znaku sekvencie, prípadne kratších úsekov. Cieľom práce bude vytvoriť model na použitie dát, ktoré poskytujú doplňujúce informácie o dlhších úsekoch sekvencie a nájsť algoritmy, ktoré s takýmto modelom budú pracovať. | anglický jazyk, záujem rozšíriť si obzory do iných oblastí (napr. biológie), kladný vzťah k algoritmom a k pravdepodobnosti, ochota aktívne sa zúčastňovať na práci bioinformatickej vedeckej skupiny (hlavne účasť na seminároch a lab meetingoch) |